Der Verwaltungsbereich Hohenmölsens hat sich seit der Wende und in den letzten Jahren stets vergrößert.
Folgende Ortschaften hat die Stadt durch Umsiedlung und Gemeindegebietsreformen für sich gewonnen:

Webau

mit den Ortsteilen Webau, Rössuln und Wählitz
Gemeindegebietsreform 2003

Werschen

mit den Ortsteilen Werschen und Oberwerschen
Gemeindegebietsreform 2003

Zembschen

mit den Ortsteilen Zembschen und Keutschen
Gemeindegebietsreform 2001

Granschütz

mit den Ortsteilen Granschütz und Aupitz
Gemeindegebietsreform 2010

Taucha

Gemeindegebietsreform 2010

Großgrimma (heute nicht mehr vorhanden)

mit den Ortsteilen Großgrimma, Grunau, Bösau, Mödnitz, Deumen und Domsen
Umsiedlung von 1991 bis 1998